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Formation « Outil informatique pour l'analyse d’une investigat
Formation « Outil informatique pour l'analyse d’une investigation d’épidémie, étude cas-témoins (et de cohorte) »
PROJET RISE
PROJET RISE
(recherche, innovation, surveillance et évaluation)
(recherche, innovation, surveillance et évaluation)
TERMES DE REFERENCE
TERMES DE REFERENCE
Dates de la formation : du 13 au 24 septembre 2021 Lieu de fo
Dates de la formation : du 13 au 24 septembre 2021 Lieu de formation : Institut Pasteur de Madagascar (avec les formateurs en ligne)
version 01-07-2021
version 01-07-2021
L'objectif du cours est de renforcer les connaissances et les c
L'objectif du cours est de renforcer les connaissances et les compétences des participants liées à l'utilisation d'applications logicielles pour l'analyse des études cas-témoins et des études de cohorte en s’appuyant sur une étude de cas concernant une investigation d’épidémie. Les études cas-témoins ou étude cohorte sont des études observationnelles car aucune intervention n'est tentée et aucune tentative n'est faite pour modifier l'évolution de la maladie. R est un langage et un environnement pour le calcul statistique et les graphiques. R fournit une grande variété de techniques statistiques adaptées aux études cas-témoins et de cohortes ainsi qu’à la production de graphiques, et est hautement extensible. RStudio est un environnement de développement intégré qui rend l'utilisation de R plus facile. RStudio offre des outils pour :
Les concepts à apprendre pendant la formation comprennent :
Les concepts à apprendre pendant la formation comprennent :
Conditions préalables Bonne connaissance de R/RStudio
Conditions préalables Bonne connaissance de R/RStudio Expérience de travail avec des données de surveillance de la santé publique Expérience dans la conduite d’études cas-témoins (ou de cohorte)
La manipulation et le stockage des données, Une suite d'opérate
La manipulation et le stockage des données, Une suite d'opérateurs pour les calculs sur les tableaux, Une vaste collection intégrée et cohérente d'outils intermédiaires pour l'analyse des données, Des fonctions graphiques pour l'analyse et l'affichage des données, à l'écran ou sur papier,
Un bref rappel des éléments de l'épidémiologie descriptive et a
Un bref rappel des éléments de l'épidémiologie descriptive et analytique : études cas-témoins, études de cohorte, stratification et analyse multivariable, biais, sélection d'un groupe de référence, contrôle des facteurs de confusion et conception de l'étude ; Concepts de base de la gestion des bases de données, y compris les bases de données relationnelles.
Les compétences à acquérir consisteront à apprendre à :
Les compétences à acquérir consisteront à apprendre à :
Cartographier ; Calculer la puissance de l'étude et la taille
Cartographier ; Calculer la puissance de l'étude et la taille de l'échantillon pour divers plans d'étude ; Sélectionner des témoins de façon aléatoire ; Réaliser des analyses pour des études cas-témoins (et étude de cohorte), y compris des analyses stratifiées et multivariables ; Produire un rapport de l'étude, en interprétant les résultats des différentes analyses.
Les compétences acquises permettront aux participants, à l'issu
Les compétences acquises permettront aux participants, à l'issue de la formation, de mener de manière autonome les activités suivantes :
Planifier et réaliser une analyse descriptive d'une étude : cré
Planifier et réaliser une analyse descriptive d'une étude : créer des courbes épidémiques, des listes de lignes et des tableaux récapitulatifs des caractéristiques des personnes et des cartes avec la distribution des cas (cartes ponctuelles ou cartes d'incidence) Choisir entre différents modèles pour mener des enquêtes épidémiologiques analytiques sur une étude ; analyser les données obtenues Communiquer les résultats d'une enquête épidémiologique.
1 Objectif de la formation
1 Objectif de la formation
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2 Contenu du programme
2 Contenu du programme
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JOUR 1
JOUR 1
- Introduction aux études de cohorte et cas-témoins ; - Sessio
- Introduction aux études de cohorte et cas-témoins ; - Session 1 : épidémiologie descriptive ; - Session 2 : analyse des caractéristiques temporelles (courbe épidémique...) ; - Session 3 : analyse des caractéristiques du lieu (cartographie des cas...) ; - Session 4 : épidémiologie analytique, analyse bivariable ; - Session 5 : épidémiologie analytique, analyse stratifiée ; - Session 6 : épidémiologie analytique, analyse multivariable ; - Session 7 : communication. - De courtes présentations formelles sur les sujets. Elles représenteront au maximum 20% du temps total consacré. Chaque présentation durera 30 minutes. - Les études de cas seront réalisées à l'aide d'ordinateurs, simulant une véritable enquête d'étude cas-témoins (80% du temps). Pendant cette activité, les animateurs superviseront, donneront le contexte des exercices, expliqueront les concepts nécessaires et clarifieront les doutes des participants.
Les méthodes d'enseignement du cours comprendront :
Les méthodes d'enseignement du cours comprendront :
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