Atelier de travail pour la préparation de la mise à l’échelle de la plateforme « Early Warning System » (EWS) à Madagascar, dans le cadre du projet AFROSCREEN

L’Institut Pasteur de Madagascar (IPM) a organisé du 15 au 19 avril 2024 à l’Hôtel Combava, Antananarivo, le 3^ème atelier de travail pour la préparation de la mise à l’échelle de la plateforme Early Warning System (EWS) et pour la mise en place d’une interopérabilité avec les systèmes nationaux existants dans les pays impliqués afin de produire un outil efficace pour les prédictions et les alertes aux épidémies.

Cet atelier s’inscrit dans le cadre du projet AFROSCREEN, financé par l’Agence Française de Développement (AFD) à hauteur de 10 millions d’euros, sous la coordination générale de l’ANRS|MIE et la coordination scientifique de l’Institut de recherche pour le développement (IRD) et l’Institut Pasteur à Paris (IPP).

Le projet AFROSCREEN a démarré en 2021, il implique un réseau de 25 instituts, dont l’IPM, répartis au sein de 13 pays d’Afrique subsaharienne. Il est mené en coordination avec Africa CDC/Pathogen Genomics Initiative. Le projet comporte deux volets : le volet 1 « laboratoire » vise à renforcer les capacités de séquençage génomique des laboratoires et à structurer un réseau de surveillance génomique pour SARS-CoV-2 et les autres pathogènes émergents et le volet 2 « épidémiologie » vise à mettre en place une surveillance sentinelle de la COVID-19 et d’autres pathogènes d’intérêt dans les formations sanitaires et les centres hospitaliers des pays.

Cet atelier de travail a réuni différents épidémiologistes et experts en analyse de données tels que des data scientists et des data managers provenant de l’Institut Pasteur de Dakar (IPD), de l’Institut Pasteur de Bangui (IPB), du Centre Pasteur du Cameroun (CPC), de l’IPP et de l’IPM. Cet atelier avait pour objectifs de :

• Préparer la mise à l’échelle de la plateforme EWS pour intégrer les données du volet 2 du projet AFROSCREEN.
• Développer un module d’interopérabilité avec les systèmes d’information de santé nationaux, tels que le DHIS2.
• Améliorer l’intégration ainsi que la qualité des données.
• Proposer un outil de visualisation synthétique des données.

En outre, l’atelier visait à concevoir et à valider des outils de formation pour les utilisateurs de la plateforme EWS.

Mr Vincent RICHARD, Médecin épidémiologiste, en poste à la Direction Internationale de l’IPP, en charge du volet « épidémiologie » du projet AFROSCREEN a déclaré : « le développement d’une plateforme automatisée d’analyse de données épidémiologiques permettra aux décideurs politiques d’avoir un accès rapide et fiable à ces données pour une meilleure prise de décision concernant les mesures de lutte et/ou de prévention à mettre en place en cas d’épidémies. »

Mr Jules TCHATCHUENG, Data Scientist au sein du Service d’Épidémiologie du Centre Pasteur Cameroun et Leader du groupe EWS a ajouté : « Pour le moment, seulement les instituts du Pasteur Network ont accès à cette plateforme. A l’issue de cet atelier, son utilisation devrait être étendue à l’ensemble des instituts du projet AFROSCREEN. »

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