Centre National de Référence pour les Mycobactéries
Les mycobactéries sont des micro-organismes du type « bacille » dont certains sont responsables de la tuberculose parmi lesquels les espèces M. tuberculosis, M. bovis, M. canetti et M. africanum.
La tuberculose (TB) est une maladie infectieuse causée par la bactérie appelée Mycobacterium tuberculosis. Elle se transmet par voie aérienne et se manifeste par une toux persistante parfois sanguinolente accompagnée, entre autres, de fièvre, d’une perte de poids et d’appétit.A Madagascar, en 2021, 40 031 cas de TB ont été notifiés (Organisation Mondiale de la Santé, 2022). La tuberculose est traitée par la prise quotidienne pendant deux à six mois de quatre antibiotiques combinés (rifampicine, isoniazide, pyrazinamide et éthambutol). Elle peut être mortelle sans traitement. Lorsque le patient présente une résistance à au moins la rifampicine et l’isoniazide, la tuberculose est dite multirésistante (TB-MR). La tuberculose est un problème de santé publique au niveau mondial.
Le Centre National de Référence des Mycobactéries (CNRM) dont une partie est hébergé par l’unité des Mycobactéries de l’IPM est l’une des structures du Ministère de la Santé Publique (MinSanP) de Madagascar. Le CNRM comprend le Service de laboratoire des mycobactéries (SLM) rattaché au Programme National de Lutte contre la Tuberculose (PNLT) du MinSanP et le laboratoire des Mycobactéries de l’IPM. Le CNRM de l’IPM effectue les tests de diagnostics de référence de TB pour le PNLT et le Centre de Biologie Clinique (CBC) de l’IPM ainsi que la surveillance nationale de la résistance aux antituberculeux à Madagascar avec le PNLT.
Au laboratoire, la TB est diagnostiquée par la microscopie, les tests moléculaires, notamment le test GeneXpert®, et est confirmée par l’isolement de la bactérie sur un milieu de culture spécifique. De plus, à l’IPM, le séquençage complet de génome à haut débit (NGS) est utilisé pour vérifier les résistances aux antituberculeux. Pour les patients avec une suspicion de TB multi-résistante, les tests de sensibilité aux antituberculeux ainsi que le suivi bactériologique des patients sous traitement sont effectués à l’IPM. L’unité des Mycobactéries dispose d’un laboratoire de Niveau de Sécurité Biologique de niveau 3.
Les activités du CNRM de l’IPM sont certifiés annuellement par deux laboratoires indépendants du réseau des laboratoires supranationaux de l’OMS, celui de Kampala en Ouganda et celui d’Anvers en Belgique.
Les données fournies par le CNRM permettent d’orienter et d’adapter les stratégies de lutte du PNLT contre la tuberculose à Madagascar.