L’unité de bactériologie expérimentale de l’Institut Pasteur de Madagascar, créée le 30 septembre 2009, mène des travaux de recherche sur les microbiotes humains et les résistances des bactéries aux antibiotiques et leurs mécanismes. Elle travaille aussi sur le diagnostic et l’épidémiologie moléculaire des bactéries isolées chez l’homme, l’animal et l’environnement, ainsi que sur des bactéries responsables de maladies sexuellement transmissibles comme le gonocoque, et maladies chez l’enfant  comme la coqueluche. Elle met en œuvre des techniques de microbiologie classiques et moléculaires, et dispose d'un spectromètre de masse de type MALDI-TOF pour l'identification bactérienne.

Recherches et activités

  • Émergence de la résistance aux antibiotiques en secteur hospitalier et en milieu communautaire,
  • Développement de tests de diagnostic rapide basés sur la technologie LAMP, une méthode d’amplification d’acides nucléiques,
  • Effet de la malnutrition et de  l’Entéropathie Environnementale Pédiatrique (EEP) sur la composition du microbiote intestinal de l’enfant malnutri,
  • Prévalence de la coqueluche et immunité en population,
  • Surveillance de la résistance aux antibiotiques des entérobactéries et gonocoques.

Réalisations

  • Mise en évidence de la séroprévalence des anticorps contre la toxine de pertussis,
  • Contribution à une meilleure compréhension sur l’interaction de l’hôte et son microbiote intestinal  par l’étude des enfants malnutries et ayant un retard de croissance,
  • Caractérisation des Klebsiella pneumoniae isolés chez des mères et leurs nouveau-nés,
  • Caractérisation des Acinetobacter baumannii résistantes à la carbapénème,
  • Deux thèses de doctorat en Sciences au sujet de la:
    • Détection rapide d’uropathogenes importants en clinique et des gènes de résistance aux β-lactamines par la technique LAMP,
    • Caractérisation phénotypique et génotypique de souches de Klebsiella pneumoniae isolées de prélèvements cliniques et en portage à Madagascar.

 Projets en cours

  • Étude de cohortes internationales sur les infections bactériennes et les maladies résistantes aux antibiotiques chez les jeunes enfants dans les pays à faible revenu (BIRDY 2),
  • Etude sur l’acquisition néonatale d’entérobactéries productrices de béta-lactamase à spectre étendu (E-BLSE) dans un pays à faible revenu (NEOLIC),
  • Détection des bactéries et parasites chez les enfants de moins de 5 ans présentant de la fièvre et de la diarrhée (DIARRHEE – RISE),
  • Étude des programmes de vaccination contre la coqueluche dans les pays à faible revenu (PERILIC),
  • Evaluation d’un test rapide pour la détection de cytokines ; biomarquers pour la détection des infections sexuellement transmissibles et la vaginose bactérienne (GIFT), 
  • Surveillance de l’antibiorésistance en Afrique (SARA).

Équipe

  • Chef d’unité: Dr Tania Crucitti
  • 1 adjointe au chef d’unité
  • 1 cadre scientifique
  • 1 gestionnaire de projet
  • 2 doctorants en sciences
  • 5  techniciens
  • 1 agent de laboratoire
  • 1 assistant financier et administratif
  • 1 chauffeur

Articles associés

Actualités

Sensibilisation à l’antibiorésistance et au mésusage des antibiotiques en Afrique, projet SARA.

Les antibiotiques ou antimicrobiens, véritable révolution du 20ème siècle, ont permis de sauver des millions de personnes depuis leur invention. Ce sont des médicaments capables de combattre les infections causées par les bactéries, comme l’infection urinaire. Sauf que les bactéries sont des êtres vivants qui évoluent en permanence, elles développent des mécanismes de résistance aux […]

Personnel

Portrait du mois – Mamitina Alain Noah RABENANDRASANA

« Nous vivons dans un monde où la pluridisciplinarité est indispensable pour progresser» Coordinateur du sous projet One Health dans le projet BIRDY2, Noah, de son vrai nom, Mamitina Alain Noah RABENANDRASANA, prépare actuellement sa thèse en science intitulée : « Dynamique et évolution de la résistance aux antibiotiques des Escherichia coli (Ec-BLSE) à Madagascar et dans l’Océan […]

Santé mère et enfant

Restitution du programme de recherche AFRIBIOTA : La malnutrition infantile

La restitution du projet AFRIBIOTA s’est tenue les 6 et 7 mars à l’Institut Pasteur de Madagascar. Un ambitieux programme de recherche multidisciplinaire destiné à mieux comprendre la malnutrition infantile. Des scientifiques nationaux et internationaux, des cliniciens ainsi que des représentants des organismes de santé publique ou œuvrant dans le domaine de la nutrition ont […]

Antibiorésistance

Madagascar: inquiétude face au phénomène de l’antibioresistance

http://www.rfi.fr/emission/20180624-madagascar-inquietude-face-phenomene-antibioresistance À Madagascar, c’est une situation qui devient inquiétante. Des chercheurs ont montré l’émergence de certaines souches de bactéries résistantes aux antibiotiques. En clair, ces bactéries se sont tellement adaptées aux médicaments qu’elles rendent aujourd’hui compliqué, voire impossible, le traitement de certaines infections. On appelle ça l’antibiorésistance. Une véritable menace pour la santé publique du […]

Santé mère et enfant

Les infections du nouveau-né à Madagascar

Le projet BIRDY initié par l’Institut Pasteur à Paris en 2012, vise à dresser un état des lieux des infections du jeune enfant dans les pays à faible revenus, notamment à Madagascar, au Sénégal et au Cambodge. Il a pour ambition de décrire ces infections et plus particulièrement celles qui sont résistantes aux antibiotiques, ainsi […]

Moustique

L’Institut Pasteur de Madagascar confirme l’intérêt de la spectrométrie de masse pour l’identification rapide des insectes vecteurs d’agents pathogènes

Les insectes vecteurs de pathogènes (et en particulier les moustiques) sont souvent identifiés à partir, soit de l’examen de leurs caractères morphologiques, soit de la détection de marqueurs moléculaires spécifiques. La première approche nécessite une solide expertise qui n’exclut pas les risques d’erreurs car de nombreuses espèces se ressemblent et la mise en œuvre de […]

Bactériologie médicale

Approches moléculaires pour la bactériologie médicale en Afrique

Cours du Réseau International des Instituts Pasteur, Institut Pasteur de Madagascar, Antananarivo – 14 au 25 novembre 2016 – Ce cours théorique et pratique vise à étudier les principales infections bactériennes contagieuses par pathologie d’organes et expérimenter le diagnostic et le typage de bactéries pathogènes prévalentes sur le continent africain et dans l’Océan Indien. Il […]

Santé mère et enfant

Lancement du programme de recherche AFRIBIOTA : une nouvelle approche dans la lutte contre la malnutrition infantile

Plus de 30 scientifiques et cliniciens malgaches et internationaux sont réunis du 07 au 09 mars 2016, à l’Institut Pasteur de Madagascar, pour le lancement officiel du projet AFRIBIOTA, un ambitieux programme de recherche multidisciplinaire destiné à mieux comprendre la malnutrition infantile chronique. Associant recherches fondamentale et clinique, notamment l’étude du microbiote intestinal des enfants, […]