L’unité de bactériologie expérimentale de l’Institut Pasteur de Madagascar, créée le 30 septembre 2009, mène des travaux de recherche sur les microbiotes humains et les résistances des bactéries aux antibiotiques et leurs mécanismes. Elle travaille aussi sur le diagnostic et l’épidémiologie moléculaire des bactéries isolées chez l’homme, l’animal et l’environnement, ainsi que sur des bactéries responsables de maladies sexuellement transmissibles comme le gonocoque, et maladies chez l’enfant  comme la coqueluche. Elle met en œuvre des techniques de microbiologie classiques et moléculaires, et dispose d'un spectromètre de masse de type MALDI-TOF pour l'identification bactérienne.

Recherches et activités

  • Émergence de la résistance aux antibiotiques en secteur hospitalier et en milieu communautaire,
  • Développement de tests de diagnostic rapide basés sur la technologie LAMP, une méthode d’amplification d’acides nucléiques,
  • Effet de la malnutrition et de  l’Entéropathie Environnementale Pédiatrique (EEP) sur la composition du microbiote intestinal de l’enfant malnutri,
  • Prévalence de la coqueluche et immunité en population,
  • Surveillance de la résistance aux antibiotiques des entérobactéries et gonocoques.

Réalisations

  • Mise en évidence de la séroprévalence des anticorps contre la toxine de pertussis,
  • Contribution à une meilleure compréhension sur l’interaction de l’hôte et son microbiote intestinal  par l’étude des enfants malnutries et ayant un retard de croissance,
  • Caractérisation des Klebsiella pneumoniae isolés chez des mères et leurs nouveau-nés,
  • Caractérisation des Acinetobacter baumannii résistantes à la carbapénème,
  • Deux thèses de doctorat en Sciences au sujet de la:
    • Détection rapide d’uropathogenes importants en clinique et des gènes de résistance aux β-lactamines par la technique LAMP,
    • Caractérisation phénotypique et génotypique de souches de Klebsiella pneumoniae isolées de prélèvements cliniques et en portage à Madagascar.

 Projets en cours

  • Étude de cohortes internationales sur les infections bactériennes et les maladies résistantes aux antibiotiques chez les jeunes enfants dans les pays à faible revenu (BIRDY 2),
  • Etude sur l’acquisition néonatale d’entérobactéries productrices de béta-lactamase à spectre étendu (E-BLSE) dans un pays à faible revenu (NEOLIC),
  • Détection des bactéries et parasites chez les enfants de moins de 5 ans présentant de la fièvre et de la diarrhée (DIARRHEE – RISE),
  • Étude des programmes de vaccination contre la coqueluche dans les pays à faible revenu (PERILIC),
  • Evaluation d’un test rapide pour la détection de cytokines ; biomarquers pour la détection des infections sexuellement transmissibles et la vaginose bactérienne (GIFT), 
  • Surveillance de l’antibiorésistance en Afrique (SARA).

Équipe

  • Chef d’unité: Dr Tania Crucitti
  • 1 adjointe au chef d’unité
  • 1 cadre scientifique
  • 1 gestionnaire de projet
  • 2 doctorants en sciences
  • 5  techniciens
  • 1 agent de laboratoire
  • 1 assistant financier et administratif
  • 1 chauffeur

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