L’unité de bactériologie expérimentale de l’Institut Pasteur de Madagascar, créée le 30 septembre 2009, mène des travaux de recherche sur les résistances des bactéries aux antibiotiques et leurs mécanismes. Elle travaille aussi sur le diagnostic (par spectromètre de masse de type MALDI-TOF et PCR) et l’épidémiologie moléculaire des bactéries isolées chez l’homme, l’animal et l’environnement, ainsi que sur des bactéries responsables de maladies négligées comme la mélioïdose (pseudo-morve). Elle met en œuvre des techniques classiques et moléculaires de microbiologie.

Recherches et activités

  • Émergence de la résistance aux antibiotiques en secteur hospitalier et en milieu communautaire
  • Développement de tests de diagnostic rapide basés sur la technologie LAMP, une méthode d’amplification d’acides nucléiques
  • Effet de la malnutrition et de  l’Entéropathie Environnementale Pédiatrique (EEP) sur la composition du microbiote intestinal de l’enfant malnutri
  • Prévalence de la coqueluche et immunité en population

Réalisations

  • Thèse de doctorat en médecine vétérinaire : étude des environnements génétiques des gènes de résistance de bactéries Gram négatif isolées à Madagascar
  • Cours international de bactériologie médicale en 2014 et 2016

Projets en cours

  • Étude de cohortes internationales sur les infections bactériennes et les maladies résistantes aux antibiotiques chez les jeunes enfants dans les pays à faible revenu (BIRDY)
  • Acquisition de bactéries résistantes aux antibiotiques et développement du microbiome intestinal des nouveau-nés dans les pays à faible revenu
  • Dynamique de transmission des bactéries multi-résistantes (BMR) dans un service de néonatalogie
  • Rôle du portage intestinal dans l’émergence mondiale de clones de Klebsiella pneumoniae multirésistants et hypervirulents: une approche de la biologie des populations
  • Développement d’un test de diagnostic rapide (LAMP) pour la détection des résistances aux antibiotiques
  • Évaluation d’un test moléculaire d’amplification isothermique (test LAMP) pour le diagnostic rapide des bactériémies chez l’enfant
  • Comparaison de plusieurs stratégies de prise en charge de la malnutrition aigüe modérée chez des enfants de 6 à 24 mois à Madagascar, au Niger, en République Centre Africaine et au Sénégal : un essai comparatif randomisé
  • Programme de recherche clinique portant sur le syndrome d’entéropathie environnemental pédiatrique à Bangui (République Centrafricaine) et à Antananarivo (Madagascar)
  • Étude des programme de vaccination contre la coqueluche dans les pays à faible revenu

Équipe

  • Chef d’unité: Dr Jean-Marc COLLARD
  • 2 techniciens
  • 3 étudiants doctorants
  • 2 étudiants en Master

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