TB-Mada-Xpert Optimisation du diagnostic des tuberculoses pulmonaires à microscopie négative et des tuberculoses extra pulmonaires à l’Hôpital Universitaire Joseph Raseta de Befelatanana d’Antananarivo, Madagascar

Contexte et justification

Dans un contexte de faible exposition au VIH (environ 1% à l’échelle du pays), les cas de TB pulmonaire à microscopie négative (TPM-) et de TB extrapulmonaires (TEP) représentent environ 34% des cas de TB. Chez les patients dont la co-infection VIH et TB est reconnue, 60% ont une forme de tuberculose de type TPM- ou TEP.

Le diagnostic bactériologique de la TB par la culture est long et rend difficile une prise en charge optimale des patients. De nouveaux outils de diagnostic précoce, faciles à utiliser comme le test GeneXpert® et le test TB-LoopampTM, constituent une réelle opportunité pour l’amélioration de la prise en charge des TPM- et des TEP. Cependant, l’évaluation et la validation de ces outils diagnostiques s’avère nécessaire avant leur utilisation en routine en milieu hospitalier.

Objectifs

Améliorer le diagnostic des TPM– et des TEP à l’Hôpital Universitaire Joseph Raseta Befelatanana (HUJRB), Antananarivo, Madagascar.

Evaluer la performance des tests GeneXpert et TB-LoopampTM pour le diagnostic des TPM- et les TEP par rapport à la culture sur milieu Löwenstein-Jensen comme méthode de référence et le diagnostic clinique de TB.

Méthodes

L’étude a obtenu l’autorisation du comité d’éthique auprès du Ministère de la Santé
Publique.

1. Recrutement des sujets

  • 400 patients hospitalisés dans les services de maladies infectieuses, de pneumologie et de neurologie au sein de l’HUJRB, suspects de TPM- ou de TEP selon des critères prédéfinis.
  • Durée de l’inclusion : 12 mois

2. Examens biologiques

  • Microscopie ; culture, tests GeneXpert et TB-Loopamp des liquides biologiques et crachats à l’IPM ;
  • Examens biochimiques-cytobactériologiques classiques des liquides biologiques au Laboratoire de HUJRB ;
  • Examen anatomopathologique des pièces biopsiques au Laboratoire d’Anatomo-pathologique de l’Hôpital Joseph Ravoahangy Andrianavalona.

Résultats

A la fin du recrutement, 488 prélèvements ont été étudiés dont 229 pulmonaires et 259 extrapulmonaires. Les scores diagnostiques indiquent une différence de sensibilité de la culture BK selon le site de prélèvement EPTB avec un meilleur rendement pour la culture avec les prélèvements ganglionnaires. La spécificité  du test GenXpert par référence à la culture est de 98,7%, avec une sensibilité de 76%, variable selon les types de prélèvements ganglionnaires. Les analyses statistiques sont en cours.

Etant donné les résultats obtenus, la technique GenXpert pourrait améliorer la prise en charge des TEP en milieu hospitalier.

Impact

Renforcement des capacités de diagnostic des TPM- et des TEP.